Le principali linee di ricerca del gruppo riguardano le malattie infettive virali e batteriche degli animali domestici e selvatici con particolare interesse rivolto sia all'aspetto eziologico (variabilità genetica/antigenica) che all'approccio diagnostico (analisi molecolari mediante PCR/RT-PCR qualitativa, real-time PCR/RT-PCR, tecnologie di sequenziamento di terza generazione e sviluppo di saggi diagnostici sierologici innovativi basati sul sistema del baculovirus ricombinante).
Per quanto riguarda i virus animali, molti degli studi, anche basati sulla sorveglianza ambientale, si concentrano sull’ecologia dei virus enterici ed epatotropi, principalmente con potenziale zoonosico, tra cui norovirus, vesivirus, sapovirus, astrovirus, picornavirus, paramyxovirus, parvovirus, hepevirus, hepadnavirus, circovirus e mammarenavirus.
Relativamente alle infezioni batteriche, le tematiche maggiormente approfondite riguardano la caratterizzazione fenotipica e genetica dei pattern di resistenza antimicrobica di batteri commensali e patogeni di animali domestici e selvatici, il sequenziamento dell'intero genoma e l'analisi metagenomica del microbiota intestinale con particolare riguardo alla resistenza antimicrobica e alla frequenza e abbondanza di geni di virulenza.
Inoltre, l’influenza delle interazioni domestiche/faunistiche, compresi i cambiamenti climatici delle nicchie ecologiche, sull'epidemiologia delle malattie virali e batteriche (presenza, distribuzione spazio/temporale, modelli di virulenza) viene studiata anche per scopi conservativi, di salvaguardia della biodiversità e per indagare la relazione con le attività umane e le specie domestiche.